Francuska alijansa Dubrovnik osnovana je kao Udruga hrvatsko-francuskog prijateljstva 1999. godine s ciljem promicanja frankofonije i širenja hrvatsko-francuskih veza, posebno kulturnih, na području dubrovačko-neretvanske županije.
Od osnutka 1999. do siječnja 2003. djeluje pod imenom « Cercle français de Dubrovnik ». Tijekom 2002.g. dobiva licencu za korištenje imena « Francuska alijansa Dubrovnik » od središnjice u Parizu. Pod tim imenom službeno postoji od 23. siječnja 2003.g.